À l’été 2016, à la réunion annuelle de l’American Society for Microbiology, les scientifiques se sont réunis pour partager et discuter des résultats liés au monde des bactéries et de la santé humaine.
Parmi les découvertes, un groupe a rapporté sur l’ensemble du génome, ou l’ensemble des gènes, pour une bactérie appelée Paenibacillus species VT 400 (PVT400). Ces bactéries avaient déjà été retrouvées dans la salive d’un patient pédiatrique atteint de leucémie lymphoblastique aiguë (ALL).
Les informations détaillées de cette étude et des études futures aideront les scientifiques à déterminer si ces bactéries peuvent jouer un rôle dans la maladie humaine, en particulier chez les personnes atteintes de leucémie aiguë qui développent une pneumonie ou des infections sanguines.
Pneumonie chez les personnes atteintes de cancer
La pneumonie est la principale cause de décès chez les patients cancéreux atteints de neutropénie, en particulier ceux atteints de leucémie aiguë. La neutropénie est un faible nombre de neutrophiles dans le sang – les neutrophiles sont des globules blancs qui sont importants pour aider le corps à combattre l’infection. Infections Les infections des voies respiratoires inférieures sont très fréquentes chez les patients cancéreux, certains rapports indiquant que 13 à 31% des patients atteints de leucémie recevant une chimiothérapie et jusqu’à 80% des greffés de cellules souches hématopoïétiques auront au moins un épisode de pneumonie. Pneum La pneumonie neutropénique est une infection potentiellement mortelle. Dans de tels scénarios, les médecins commencent immédiatement l’antibiothérapie sans attendre que les résultats de laboratoire confirment et précisent le type d’infection bactérienne – car il est si important de commencer le traitement immédiatement, afin de réduire le risque que le patient succombe à l’infection.
En fait, la thérapie préventive est utilisée dans certaines circonstances, qui sont détaillées ci-dessous.
Les progrès récents dans la prise en charge de la pneumonie neutropénique suscitent l’espoir de meilleurs résultats. Plusieurs sociétés médicales ont publié des directives mises à jour pour l’antibiothérapie de la pneumonie neutropénique suspectée.
Et il est possible que de nouveaux agents qui favorisent les réponses de l’organisme à l’infection puissent encore améliorer l’activité des antibiotiques.
Mettre l’accent sur les agents pathogènes chez les patients atteints de neutropénie
Les directives de l’American Society of Clinical Oncology (ASCO) recommandent que les médecins tentent de prévenir l’infection chez les patients externes présentant une neutropénie profonde mais pas de fièvre. Un traitement antibactérien et antifongique est recommandé si les neutrophiles doivent rester en dessous de 100 / μL pendant plus de sept jours. La directive stipule que l’agent préféré pour la thérapie préventive antibactérienne est une fluoroquinolone orale, alors que pour la thérapie antifongique est un triazole oral.
Les patients atteints de neutropénie sont sensibles à une plus grande variété de pathogènes que leurs homologues. Il peut être utile pour les médecins de savoir d’où proviennent les bactéries pour prédire quels antibiotiques ils sont susceptibles d’être résistants, et donc quelles sont les stratégies les plus susceptibles d’être les plus efficaces.
Espèces de Paenibacillus
À cette fin, les scientifiques ont étudié PVT400, la nouvelle bactérie isolée du patient atteint de leucémie, un membre du genre Paenibacillus, une famille d’espèces bactériennes en forme de bâtonnet. Différentes espèces de ce groupe ont été isolées du sol, de l’eau, des plantes, du lait et d’autres sites.
Cependant, les espèces de Paenibacillus n’étaient pas connues pour causer des maladies humaines … jusqu’à ce que des rapports récents ont montré l’implication possible de trois espèces différentes de Paenibacillus dans les maladies humaines.
Après l’isolement de PVT 400 dans la salive d’un patient pédiatrique atteint de leucémie lymphoblastique aiguë, les premières études ont montré une certaine similitude de ces isolats avec l’espèce amylolyticus, que l’on trouve dans l’intestin postérieur larvaire de la mouche; cependant, à ce jour, il est toujours vrai que P. amylolyticus n’a pas été détecté chez les humains, et d’autres études ont montré des différences entre la bactérie VT 400 trouvée chez le patient atteint de cancer et d’autres souches de P.
amylolyticus.
Ainsi, lorsque les chercheurs ont étudié l’ensemble du génome du VT 400, il y avait un certain nombre de résultats intéressants. Il avait des gènes codant des mécanismes de résistance aux médicaments de chimiothérapie, comme la tunicamycine et la bléomycine. Ils ont également trouvé des gènes pour les pompes bactériennes associées à la multirésistance, ainsi que des gènes codant pour la résistance aux antibiotiques, y compris la vancomycine, la fosmidomycine, la tétracycline ainsi que des médicaments ressemblant à la pénicilline ou les bêta-lactamines.
Les auteurs de cette étude génomique ont noté que la séquence génomique complète de Paenibacillus sp. La souche VT 400 aidera à déterminer le rôle des espèces de Paenibacillus dans les maladies humaines et fournira un aperçu de la composition des bactéries normales vivant chez les patients atteints de cancers du sang.
